超微量分光光度计
过去，比色皿分光光度计是通过吸光度定量DNA浓度的唯一可用选项。由于所需的大样本量和分子生物学中可用的小样本量，因此该应用受到很大限制。比色皿分光光度计的灵敏度比微量分光光度计要好，但所需的样品量非常大：半微量比色皿为300-400 µL，超微比色皿为70 µL。只有通过引入超微量分光光度计才能实现该方法应用的真正突破，该分光光度计可以测量通常为1 µL的微小液滴。用于DNA定量的比色皿分光光度计已基本被放弃，超微量体积分光光度计是用于单样品吸收测量的首选仪器。
用超微量分光光度计对DNA进行定量分析既简单又直接，但是必须单独测量样品，并且样品之间的清洁步骤很短。当需要对大量样品进行定量时，可以使用微孔板读数仪在更短的时间内测量更多样品。
微孔板光吸收读数仪
微孔板读数仪可以在短时间内测量许多样品，典型的板式为96孔和384孔，有些读数仪还可以读取1536孔或更多孔的板。与超微量分光光度计相比，微孔板读数仪的确在计算DNA浓度方面存在一些局限性：
- 微孔板读数仪需要较大的样品量进行测量，但这可能取决于孔板的类型和制造商。孔密度越高，最小工作量越小，并且有小体积版本的常见微孔板可供选择。与超微量分光光度计中的测量相比，微孔板中的测量仍需要几倍的样品体积。在本文末尾的表格中，您将找到常见微孔板类型的最小工作量
- 无法使用标准的聚苯乙烯微孔板，因为它们会阻挡紫外线，大多数主要制造商目前都可提供不阻挡紫外线的特殊微孔板。尽管它们比聚苯乙烯微孔板更昂贵，但它们比石英或石英底微孔板更实惠，更方便。
- 当计算DNA浓度时（见DNA定量方法），光程是一个重要因素，并且取决于孔的几何形状和样品量。计算DNA浓度的公式需要1 cm的光程，并且在微孔板测量中必须使用光程校正。通过测量900和975 nm处样品的吸光度，可以很容易地计算出光程校正。
用于DNA定量的微容量微孔板
解决所有这三个问题的方法是使用微孔板进行DNA定量。 这种类型的微孔板使用的样品量很小（通常为2 µL），对紫外线是透明的，并且具有固定的光程长度，可以很容易地将其应用于计算中，而无需进行额外的测量。 尽管它们没有标准微孔板那么多的样品位置（通常是16个，而不是96个），但它们在样品量和通量之间提供了很好的折衷方案。 为了在微孔板读数仪中方便地定量DNA，我们提供了µDrop板，包括参数文件，可使用MikroWin软件轻松进行测量和计算。
就微孔板读数仪的选择而言，唯一的要求是能够测量低至230 nm的紫外线（因为该波长用于评估DNA的纯度）。 基于滤光片的读数仪和基于光栅的读数仪均适用于此应用程序。